企业申请批发零售认证证书需要做的准备包括以下五个方面：

一、了解认证标准和要求

在申请批发零售认证证书之前，企业需要了解相关的认证标准和要求。这些标准和要求可能因地区、行业和认证机构而异，因此企业需要认真研究并了解自己所在行业的认证标准和要求，以便为自己制定合理的申请计划。

二、建立质量管理体系

为了满足认证机构对质量管理体系的要求，企业需要建立和完善自己的质量管理体系。这个体系应该包括质量方针、质量目标、质量计划、质量记录、质量检测和质量改进等方面的内容，以确保企业的经营活动符合相关法规和标准。

三、准备申请材料

企业需要准备申请批发零售认证证书所需的各项材料，包括企业资质证明、经营许可证明、质量管理体系认证证书、经营计划书、财务报表等。此外，还需要提供企业近期的生产和检测记录，以及与供应商和客户的合同和发票等相关文件。

四、配合认证机构审核

在申请批发零售认证证书的过程中，认证机构会对企业进行审核，包括文件审核和现场审核两个方面。企业应该积极配合认证机构的审核工作，并及时提供所需文件和信息。

五、改进不足之处

如果认证机构在审核过程中发现企业存在不符合认证要求的问题，企业应该认真对待并积极改进。在改进过程中需要注意管理体系的有效性和可操作性，同时要确保改进措施的合理性和科学性。只有在全部问题得到妥善解决后，企业才能顺利获得批发零售认证证书。